MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 7011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187120	ATT	2	6	196	201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247157
2	NT_187120	CAC	2	6	227	232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247157
3	NT_187120	GCC	2	6	285	290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247157
4	NT_187120	ATT	2	6	351	356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247157
5	NT_187120	CGA	2	6	359	364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247157
6	NT_187120	ACC	2	6	369	374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247157
7	NT_187120	GCG	2	6	382	387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247157
8	NT_187120	ATT	2	6	450	455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247157
9	NT_187120	CAC	2	6	539	544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247157
10	NT_187120	GC	3	6	586	591	0 %	0 %	50 %	50 %	409247157
11	NT_187120	CAC	3	9	608	616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247157
12	NT_187120	GCG	3	9	643	651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247157
13	NT_187120	CAT	3	9	659	667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247157
14	NT_187120	GCG	2	6	715	720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247157
15	NT_187120	ACG	2	6	769	774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247157
16	NT_187120	CGG	2	6	803	808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247157
17	NT_187120	ACC	2	6	852	857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247157
18	NT_187120	GCG	2	6	862	867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247157
19	NT_187120	GGT	2	6	939	944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247157
20	NT_187120	GCC	2	6	1023	1028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247157
21	NT_187120	TCA	2	6	1033	1038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247157
22	NT_187120	GGCG	2	8	1064	1071	0 %	0 %	75 %	25 %	409247157
23	NT_187120	CTG	2	6	1074	1079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247157
24	NT_187120	TCG	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247157
25	NT_187120	GC	3	6	1246	1251	0 %	0 %	50 %	50 %	409247157
26	NT_187120	CAG	2	6	1316	1321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247157
27	NT_187120	GCG	2	6	1357	1362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247157
28	NT_187120	AGA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247157
29	NT_187120	AAC	3	9	1470	1478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247157
30	NT_187120	GC	3	6	1495	1500	0 %	0 %	50 %	50 %	409247157
31	NT_187120	ACA	3	9	1567	1575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247157
32	NT_187120	GGT	2	6	1590	1595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247157
33	NT_187120	CGG	2	6	1748	1753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247157
34	NT_187120	CTGA	2	8	1764	1771	25 %	25 %	25 %	25 %	409247157
35	NT_187120	AAC	2	6	1869	1874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247157
36	NT_187120	ATA	2	6	1905	1910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247157
37	NT_187120	GCA	2	6	1975	1980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247157
38	NT_187120	ATG	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247157
39	NT_187120	CCG	2	6	1996	2001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247157
40	NT_187120	CGG	2	6	2045	2050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247157
41	NT_187120	GGT	2	6	2091	2096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247157
42	NT_187120	ACA	2	6	2151	2156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247157
43	NT_187120	AGC	2	6	2163	2168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247157
44	NT_187120	ATG	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247157
45	NT_187120	CCA	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247157
46	NT_187120	GAT	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247157
47	NT_187120	GTC	2	6	2364	2369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247157
48	NT_187120	CGCCAC	2	12	2396	2407	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409247157
49	NT_187120	CAA	2	6	2429	2434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247157
50	NT_187120	ATG	2	6	2448	2453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247157
51	NT_187120	GCG	2	6	2461	2466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247157
52	NT_187120	CCG	2	6	2500	2505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247157
53	NT_187120	CGA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247157
54	NT_187120	CGG	2	6	2561	2566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247157
55	NT_187120	CAG	3	9	2637	2645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
56	NT_187120	CGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
57	NT_187120	CGA	2	6	2697	2702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
58	NT_187120	CGAC	2	8	2711	2718	25 %	0 %	25 %	50 %	409247158
59	NT_187120	TC	3	6	2734	2739	0 %	50 %	0 %	50 %	409247158
60	NT_187120	TGG	2	6	2745	2750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247158
61	NT_187120	TTA	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247158
62	NT_187120	CAT	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247158
63	NT_187120	GCG	2	6	2849	2854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247158
64	NT_187120	CAG	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
65	NT_187120	CGG	2	6	2979	2984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247158
66	NT_187120	CAA	2	6	2991	2996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247158
67	NT_187120	ACA	2	6	3025	3030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247158
68	NT_187120	AAC	2	6	3049	3054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247158
69	NT_187120	CGG	2	6	3135	3140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247158
70	NT_187120	AAC	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247158
71	NT_187120	GTGG	2	8	3160	3167	0 %	25 %	75 %	0 %	409247158
72	NT_187120	AAT	2	6	3259	3264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247158
73	NT_187120	ATA	2	6	3293	3298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247158
74	NT_187120	TAA	2	6	3318	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247158
75	NT_187120	CAC	2	6	3390	3395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247158
76	NT_187120	A	6	6	3426	3431	100 %	0 %	0 %	0 %	409247158
77	NT_187120	GGC	2	6	3436	3441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247158
78	NT_187120	ACG	2	6	3455	3460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
79	NT_187120	CAA	2	6	3483	3488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247158
80	NT_187120	CAC	2	6	3558	3563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247158
81	NT_187120	CCG	2	6	3605	3610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247158
82	NT_187120	AAC	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247158
83	NT_187120	GCA	2	6	3680	3685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
84	NT_187120	TGA	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247158
85	NT_187120	GCG	2	6	3779	3784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247158
86	NT_187120	GAC	2	6	3844	3849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
87	NT_187120	ACC	2	6	3859	3864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247158
88	NT_187120	GCA	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
89	NT_187120	ACC	2	6	4021	4026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247158
90	NT_187120	GCA	2	6	4052	4057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
91	NT_187120	CTGA	2	8	4060	4067	25 %	25 %	25 %	25 %	409247158
92	NT_187120	GC	3	6	4205	4210	0 %	0 %	50 %	50 %	409247158
93	NT_187120	CAA	2	6	4227	4232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247158
94	NT_187120	CAC	2	6	4260	4265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247158
95	NT_187120	AGTG	2	8	4293	4300	25 %	25 %	50 %	0 %	409247158
96	NT_187120	CAA	2	6	4310	4315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247158
97	NT_187120	CGC	2	6	4368	4373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247158
98	NT_187120	GTG	2	6	4405	4410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247158
99	NT_187120	GCCA	2	8	4492	4499	25 %	0 %	25 %	50 %	409247158
100	NT_187120	CGG	2	6	4575	4580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247158
101	NT_187120	CAGT	2	8	4584	4591	25 %	25 %	25 %	25 %	409247158
102	NT_187120	TGA	2	6	4620	4625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247158
103	NT_187120	AAC	2	6	4639	4644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247158
104	NT_187120	CAG	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
105	NT_187120	CAA	2	6	4704	4709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247158
106	NT_187120	CAG	2	6	4732	4737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
107	NT_187120	ATG	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247158
108	NT_187120	AGCGC	2	10	4853	4862	20 %	0 %	40 %	40 %	409247158
109	NT_187120	CGG	2	6	4901	4906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247158
110	NT_187120	GCTACC	2	12	4960	4971	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409247158
111	NT_187120	GGC	2	6	4978	4983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247158
112	NT_187120	GCG	2	6	5032	5037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247158
113	NT_187120	GGC	3	9	5071	5079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247158
114	NT_187120	CAG	2	6	5112	5117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247158
115	NT_187120	GGAA	2	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	409247158
116	NT_187120	TAAA	2	8	5212	5219	75 %	25 %	0 %	0 %	409247158
117	NT_187120	A	8	8	5485	5492	100 %	0 %	0 %	0 %	409247159
118	NT_187120	ATT	2	6	5507	5512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247159
119	NT_187120	TGC	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247159
120	NT_187120	ATTTCT	2	12	5527	5538	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	409247159
121	NT_187120	ATT	2	6	5542	5547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247159
122	NT_187120	AAT	2	6	5573	5578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247159
123	NT_187120	TCA	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247160
124	NT_187120	TCG	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247160
125	NT_187120	ACA	2	6	5871	5876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247160
126	NT_187120	CGG	2	6	5970	5975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247160
127	NT_187120	CAG	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247160
128	NT_187120	CAT	2	6	6018	6023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247160
129	NT_187120	CGG	2	6	6034	6039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247160
130	NT_187120	TCG	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247160
131	NT_187120	TTC	2	6	6071	6076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247160
132	NT_187120	CAG	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247160
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259	NT_187120	CCA	2	6	12699	12704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247168
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262	NT_187120	A	6	6	12834	12839	100 %	0 %	0 %	0 %	409247168
263	NT_187120	CGC	2	6	12861	12866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247168
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270	NT_187120	CTGG	2	8	13106	13113	0 %	25 %	50 %	25 %	409247168
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280	NT_187120	CAG	2	6	13459	13464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247168
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289	NT_187120	ACC	2	6	13778	13783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247168
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292	NT_187120	ACC	2	6	13844	13849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247168
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356	NT_187120	CGG	2	6	17456	17461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247172
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386	NT_187120	T	6	6	18707	18712	0 %	100 %	0 %	0 %	409247174
387	NT_187120	CGC	2	6	18770	18775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247174
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391	NT_187120	CCA	2	6	18959	18964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247175
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